A continuación se presenta el detalle de las auditorías al ejercicio presupuestario realizadas a este Organismo () por la Contraloría General de la República.

Nombre del informe	Número del informe	Entidad que efectuó la auditoría	Unidad auditada	Materia	Período auditado	Fecha de inicio de la auditoría	Fecha de término de la auditoría	Enlace al informe final de auditoría	Fecha de publicación del informe	Enlace al informe de aclaraciones, si correponde
Informe final sobre auditoria a las obras de Conservación del Aeropuerto Internacional A.M.Benitez, Dirección de Aeropuertos, Ministerio de Obras Publicas	Oficio N072333 del 30/12/2009 informe N67 de 2009	Contraloría General de Gobierno	Dirección Regional Metropolitana	Inversiones en infraestructura	01-01-2008 al 01-09-2009	S/I	30-12-2009	ver enlace	30/12/2009	No aplica
Informe final auditoria sobre transacciones en la Dirección de Aeropuertos MOP	Oficio N068496 del 09/12/2010 informe N66 de 2009	Contraloría General de Gobierno	División de Construcción y Mantencin	Transacciones en el desarrollo de estudio y diseño	01-12-2008 al 31-08-2009	S/I	09-12-2009	ver enlace	09/12/2009	No aplica